Sebagai salah satu gereja anggota Persekutuan Gereja Gereja di Indonesia (PGI), GKJW turut mengutus perwakilannya, yaitu Pdt. Natael Hermawan Prianto (Ketua Majelis Agung GKJW) dan Pdt. Agung Siswanto (Sekretaris Umum Majelis Agung GKJW) untuk mengikuti Sidang Raya ke-XVIII PGI yang dilaksanakan mulai pada 8-14 November 2024 di Rantepao, Toraja, Provinsi Sulawesi Selatan yang dituan-nyonya-rumahi oleh Sinode Gereja Toraja (GT).
Salah satu agenda utama dari Sidang Raya yang setidaknya melibatkan sekitar 5.000 peserta dan tamu undangan dari berbagai kalangan tersebut adalah pemilihan Majelis Pekerja Harian PGI (MPH PGI) untuk periode 2024-2029.

Melalui proses pemilihan demokratis di tengah-tengah pelaksanan Sidang Raya pada hari Selasa, 11 November 2024, nama-nama yang dipercaya untuk melanjutkan kepengurusan PGI Nasional atau yang biasa disebut sebagai Majelis Pekerja Harian PGI (MPH PGI) untuk periode 2024-2029 adalah sebagai berikut:
Ketua Umum : Pdt Dr Jacky Manuputty (Gereja Protestan Maluku),
Ketua 1 : Pdt. Dr. Alfred Angguy (Gereja Toraja),
Ketua 2 : Dr. Olly Dondokambey (Gereja Masehi Injili di Minahasa),
Ketua 3 : Pdt. Dr. Merry Kolimon (Gereja Masehi Injili di Timor),
Ketua 4 : Pdt. Dr. Simpon Lion (Gereja Kalimantan Evangelis),
Sekretaris Umum : Pdt. Darwin Darmawan, MA (Gereja Kristen Indonesia),
Wakil Sekretaris Umum: Pdt. Lenta Simbolon, MA, M.Th (Huria Kristen Indonesia),
dan Bendahara Umum : Yusak Budi Kurniawan (Gereja Kristus Yesus).
Sedangkan yang dipercaya sebagai anggotanya adalah:
1. Pdt. Ira Imelda, M. Th (Gereja Kristen Pasundan),
2. Pdt. Tertius Lantigimo (Gereja Kristen Sulawesi Tengah),
3. Pdt. I Made Budiarsa (Gereja Kristen Protestan di Bali),
4. Pdt. Dr Welman Boba (Gereja Masehi Injili di Timor),
5. Pdt. Dr Asnath Niwa Natar, M. Th (Gereja Kristen Sumba),
6. Pdt. Geget Elte Hyang L, S. Si Teol (Gereja-Gereja Kristen Jawa),
7. Dk. Michael Andepa Pinem (Gereja Batak Karo protestan).
Segenap keluarga besar Greja Kristen Jawi Wetan mengucapkan selamat kepada segenap terpilihnya pengurus MPH PGI untuk periode 2024-2029. Kiranya cinta Kasih Tuhan Yesus, Sang Kepala Gereja memampukan segenap pengurus yang baru untuk mengidupi visi dan misi PGI mewujudkan Gereja Kristen Yang Esa di Indonesia dalam semangat ekumenis.